具體說來有如下禁忌證：
(1)嚴重心肺功能不全時。
(2)嚴重高血壓、腦供血不足、冠狀動脈硬化、明顯心律紊亂時。
(3)腹膜炎和中毒性急性消化道炎癥(中毒性痢疾、暴發型潰瘍性結腸炎、急性胃腸炎等)時。
(4)急性消化道大出血、腸道積血或積血過多妨礙觀察時。
(5)近期胃腸道或盆腔作過手術及放射治療時。
(6)因手術及炎癥致使腹腔內粘連或形成硬性扭曲時。
(7)肛門狹窄及肛門急性炎癥時。
(8)腸道有狹窄時，對狹窄以上的腸管不能勉強進鏡。
(9)精神病患者或不能配合者。 (10)女性妊娠期及月經期。